Sur le plan de la terminologie, on dit en Japonais Densha pour le train.
La Japan Rail, ou en l'occurrence la JR East à Tokyo, ne propose que des trains dont la fameuse et très pratique ligne circulaire Yamanoté qui permet de se rendre aux principaux quartiers de Tokyo.
JR East compte 36 lignes qui se différencient les unes des autres par leur code couleur.
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Sur le plan de la terminologie, on dit en Japonais Chikatétsou pour le métro.
Plusieurs compagnies ferroviaires quadrillent la ville de façon complémentaire ou concurrente, il n'existe pas de plan officiel couvrant l'ensemble du réseau, toute compagnie confondue.
Pour les itinéraires, il est recommandé d'utiliser le service d'Hyperdia qui, non seulement, vous indiquera le chemin, mais aussi vous tarifiera votre trajet.
En général, la desserte des lignes s'interrompt de 0h00 à 5h. En dehors de cette plage, la fréquence des lignes est régulière, voire très dense.
Les indications sont en général écrites sous 3 alphabets différents : idéogrammes ou « Kanji » (上野), alphabet japonais « Hiragana » (うえの) et écriture romane (Uéno).